Posiblemente fundado en el año 952, poco se sabe sobre los primeros ciento cincuenta años de historia más allá de que acabó abandonado a principios del siglo XII. En el año 1142 fue fundado de nuevo cuando San Bernardo envía desde Claraval (Francia), de donde es abad, una comunidad de monjes. El 14 de febrero de 1142, comienza en Santa María de Sobrado la vida monástica cisterciense. Durante el resto del siglo XII y el siglo XIII el monasterio desenvuelve una grand actividad espiritual y económica. De esta actividad se conservan la capilla funeraria de Magdalena, la sala capitular y algunas partes sueltas. Después en una etapa de decadencia el monasterio recupera de nuevo parte de su grandeza en el año 1498 cuando se incorpora a este la Congregación de Castilla. La mayoría de los edificios que actualmente se conservan comienzan a construirse a partir de esta nova época. La monumental iglesia se finaliza a finales del siglo XVII y se consagra en 1708. El monasterio sufrirá una nueva etapa de decadencia en el siglo XIX que culmina o 21 de septiembre de 1834 cuando, con la desamortización, el Monasterio queda suprimido por real orden. Todo el complejo fue vendido y con el tiempo todos sus edificios acaban en ruinas, hasta que en el año 1954, por encargo del cardenal Quiroga Palacios, Arzobispo de Santiago, el Monasterio Cisterciense de Viaceli, situado en Cóbreces (Cantabria) comienza la tarea de reconstrucción de Sobrado. En el mes de julio de 1966 se envía una comunidad de monjes y el 25 de julio comienza de nuevo la vida monástica cisterciense en el Monasterio.
